SymMap:中医药证候关联数据库

一、数据库简介

SymMapSymptom Mapping是一个中医药证候关联数据库。数据库于20188月发表于核酸研究杂志(NucleicAcids Research)。该数据库收录了2015版中国药典包含的499种草药以及对应的1717个中医证候,并将中医症状对应到961个西医症状,同时收录了5235个与这些证候关联的疾病、19595个草药成分、4302个药物靶点,以及这六种类型的数据之间的关联关系。SymMap通过这种方式将中国传统医学与现代医学从表型到分子层面加以关联。

访问地址:http://www.symmap.org/

下表列出了数据库中数据的来源。

下图是SymMap数据构架及数据关系图。中间是SymMap中包括的六类数据:草药、成分、靶标、疾病、中医证候、现代医学症状。左侧是数据库包含的六类数据间的直接关联关系:草药中医证候关联关系6338对、草药成分关系48372对、中医证候西医症状关联关系2978对、成分靶标关系29370对、靶标疾病关系7256对、西医症状疾病关系12107对。右侧列出了数据库包含的数据之间的9种间接关联关系及其数量。

 

二、草药查询

 

以黄连为例,介绍草药信息查询。查询步骤见下图。

 

在下一个页面获得草药的药性、药味、归经信息。

这个页面往下拉,是这个草药的草药中医证候西医症状成分靶标疾病关联网络,此网络可下载。

 

再往下拉,是草药与其它5类数据的关联关系列表。首先选择查看与其中某一类数据的关联关系,例如下图选择查看与中医症状的关系。接着,可以选择按不同程度的统计分析结果来呈现,点select右边的框,可以选择查看所有,或者按照p值或fdr值查看结果。最后点击“download”按钮可以下载关联列表。

查询该草药的成分和对应靶标方法见下图: 

 

 

三、查询其它数据

同理,在查询页面,可以分别以中医证候、西医症状、成分、靶标、疾病为关键词查询,不再赘述。

参考文献:

Wu Y, Zhang F, Yang K, Fang S, Bu D, Li H,Sun L, Hu H, Gao K, Wang W et al: SymMap: an integrative database oftraditional Chinese medicine enhanced by symptom mapping. Nucleic Acids Res2019, 47(D1):D1110-d1117.

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