PubMed专题:(三)文献大批量阅读、收藏管理及跟新

在前两期的推送中,针对PubMed的搜索与结果筛选做了一个介绍。在该次推送,主要还是针对PubMed,给大伙在使用的时候,分享下笔者的一些技巧。主要有:

1. 搜索结果的大批量阅读

2. 文献整理、收藏与多次利用

3. 创建PubMed的更新提醒(相当文献跟新)

1

 搜索结果的大批量阅读

当执行完搜索,我们不免需要对搜索结果进行进一步的筛选,其中包括条件筛选与内容筛选两部分。条件筛选,在上一期推送已经做了介绍,不太熟悉的读者可以再看下上一期推送。

这里谈下内容筛选。

(执行完搜索、结果的条件筛选的界面)

可以看到条件筛选后的界面,离我们想要的一段距离。为此,笔者给大伙分享下关于内容筛选的小技巧,它可以让我们的搜索界面变得更像我们所需要的。

一是利用好搜索结果界面的上栏参数:Format(显示的格式),Sort by(以什么作为排序依据),Per page(每一页显示多少搜索结果)。至少每个分栏怎么选,大伙可以多尝试下,多操作下,自然感觉就来了。

二是可利用下Chrome浏览器的网页翻译等辅助工具(如果英语不太好的话)。

这样的话,即可实现:

一、一页即可完成的内容筛选。无需一个一个点,一页一页翻,去了解每个文献的内容;

二、结合相应的一些工具(不建议常用),可跨越语言上的一些障碍。

那么,结合条件筛选,进一步到文献的内容筛选,这样的操作流程,相信可以很快的找到自己想要的文献。

2

培养感兴趣文献的收藏习惯

进一步的,当我们完成了搜索结果的条件和内容筛选,找到了想要的文献。那么,是不是把文献给下载了,就可以意味了结束了呢?

在笔者看来,是可以结束了的,不过这会是个比较低效率的使用习惯。

01

对文献的整理与收藏不到位

一般而言,我们的目的文献往往不止一篇,而是好几篇,甚至十来篇,那么下载后,学会按相应的了解目的进行分类是一层面,另一层面,过多的文献集中,会导致文献阅读的效率不理想,即每一篇文献该有相应的目的性。

02

给文献的二次或多次利用带来不便

事实上,我们在一些比较受用的文献上,往往需要二次或多次阅读或利用。另外,这样的话,会给后续的论文写作中的文献插入增加工作量,难道再一次一篇文献一篇文献的搜索,然后一个一个的导入到Endnote?

为解决以上问题,笔者建议,在看得自己的想要文献的同时,可多利用NCBI账号所赋予你的收藏功能,建立不同的收藏夹,收藏不同类别的文献,一来解决了分类,二来可大批量地将文献导入到Endnote,三来可多次回顾和浏览。 

操作步骤如下。

接着,收藏成功。当需要时,进入My NCBI首页,即可看到。

You get it.

3

创建PubMed的更新提醒

我们都知道,对文献阅读来说,与我们领域的最新研究保持同步,这是至关重要的一步。我们都不会希望在研究中走一条路,然后才发现它已经完成。另外,估计谁都不太喜欢手动搜索、浏览PubMed结果的页面来知道你是否真的已经看过这篇文献?

事实上,PubMed早已为你考虑到这点。当我们试图跟上感兴趣的领域的文献时,这尤其有用。有两种方法可以接收PubMed的更新提醒:

1.电子邮件

2.RSS源

当中,及时了解正在发生的文献最新进展的最简单方法——创建PubMed提醒(电子邮件)。在方便的时候,它会自动通过电子邮件向我们发送一组预定义的搜索字词的结果,以便在闲暇时浏览它们,且每封电子邮件都会包含一批新的论文。操作步骤如下:

第1步:注册NCBI账号,并登陆

与大多数事情一样,你必须先注册一个帐户才能使用者功能。在PubMed主屏幕上,单击“登录”,然后选择“注册帐户”。填写所有详细信息,然后单击“注册”。

第2步:执行你想要的搜索

确保已登录自己的帐户(用户名应显示在PubMed主屏幕的右上角)。

那么,搜索你感兴趣的术语(结合高级搜索,尽量精准,否则PubMed的后续更新提醒效果会大打折扣),执行搜索。

第3步:保存您的搜索

执行完搜索后,可得到以下界面。

 

以搜索“(P53[Title]) AND cancer[Title/Abstract]”为例,评价下搜索结果的精准度是否满足你的需要。确认后,点击搜索框下的Create alert,即可进入PubMed的更新提醒设置。 

接着,在下一个屏幕上,为你的搜索命名(可以设置多个常规搜索,因此将它们命名为易于识别的内容可能很有用)并单击“保存”,即可完成。

当中,建议根据你的喜好,填写好下面选项。主要有三个方面:

1.提供搜索的频率:每月一次,每周一次或每天一次。

2.搜索结果的格式:与搜索结果的上栏“Format”相一致。建议选择“摘要”(会有文章的摘要);“MEDLINE”如果你希望能够将引用导入EndNote或Refworks,则选择最后一个。另外,请注意,“摘要”和“摘要”选项后面可能有“(文本)”,如果你不想接收HTML格式的电子邮件,请选择后者。

3.发送的最大文献数量:可以选择5到200,并且即使上次搜索后没有出现新结果,也可以选择将电子邮件发送给你。

最后,点击“保存”,就成功了!这样,你的搜索更新已设置完毕,搜索结果应该会发送到你的电子邮件收件箱,以便你仔细阅读并选择与你最相关的搜索结果。

此外,针对读者的留言,笔者在下一期中对PubMed专题增加了番外篇-MeSH搜索,欢迎持续关注~

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