文献解读:非小细胞肺癌+预后生信分析

摘要

整合素在细胞增殖、迁移、分化、肿瘤侵袭和转移的调控过程中起着至关重要的作用。ITGA11、ITGB4和ITGB8是整合素家族的三个编码基因。越来越多的证据证明,ITGA11、ITGB4和ITGB8的异常表达在不同的恶性肿瘤中普遍存在。然而,它们在非小细胞肺癌(NSCLC)患者中的表达模式和预后作用尚未完全阐明。

研究结果

图1

图1:TGA11、ITGB4和ITGB8在不同肿瘤组织和正常组织中的转录水平在肿瘤数据库中的比较。细胞颜色由细胞内分析的最佳基因等级百分位数决定。

图2

图2:GEPIA中非小细胞肺癌组织与正常组织中ITGA11(A)、ITGB4(B)和ITGB8(C)的表达水平。*表明结果具有统计意义。

图3

图3:非小细胞肺癌(HPA数据库)中ITGA11、ITGB4和ITGB8的免疫组织化学分析。

(A-F)LUAD和LUSC组织中ITGA11和ITGB4的蛋白表达分别显著高于正常肺组织。

(G-I)LUSC组织中ITGB8蛋白表达水平明显高于正常肺组织。

图4

图4:基于GEO数据集的LUAD组织与正常对照ITGB4表达的Meta分析

(A)来自登记的GEO数据集的SMD森林小区比较LUAD组织中ITGB4的表达与正常对照。

(B)已登记的地球观测组织数据集的敏感性分析。

(C)评价已登记的地球观测数据集的出版偏差(埃格尔检验,p=0.7759)。

图5

图5:LUAD和LUSC(GEPIA数据库)的总体生存(OS)的Kaplan-Meier生存曲线。

根据ITGA11、ITGB4和ITGB8在LUAD(A-C)和LUSC(D-F)中高表达和低表达的OS生存曲线。

结论

提示ITGA11和ITGB4可能同时作为LUAD和LUSC的诊断标志物,而ITGB8可能作为LUSC的诊断标志物。此外,ITGB4可作为LUAD的潜在预后生物标志物。

DOI:10.7717/peerj.8299

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