北京新冠基因序列公布:具有D614G突变

6月18日晚,中国疾病预防控制中心通过“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”正式发布2020年6月北京新发地新冠疫情及病毒基因组序列数据。该中心还同时向世界卫生组织及全球共享流感数据倡议组织(GISAID)提交了新冠疫情及病毒基因组序列数据,与国际社会共享这一数据。

此次提交的3组病毒序列信息中,2组分别来源于53岁与25岁的男性患者(NMDC60013902-01、NMDC60013903-02),1组来源于环境样本(NMDC60013903-03),均采集于6月11日。根据上传的病毒序列信息,本次在北京流行的新冠病毒隶属于进化枝20B(图1),而该进化枝常见于欧洲,与该序列最接近的病毒来源于捷克、中国台湾、希腊以及葡萄牙。

3组病毒序列均携带D614G突变。根据此前报道,D614G突变毒株自今年2020年2月出现以来,感染人数不断飙升,已经取代2019年的原始毒株成为全球主流病毒株。美国两家研究机构近日对出现在S蛋白中的D614G变异做了初步研究,发现新冠病毒S蛋白的D614G突变可能会提升新冠病毒感染细胞的能力。武汉大学病毒学国家重点实验室研究组长、生命科学学院教授陈宇认为,仍需进一步的科学验证才能对毒株致病力的差异下结论。

上个月,美国洛斯阿拉莫斯国家实验室领导的一项多国研究团队就发现了“D614G”突变株。该团队领导者为因艾滋病研究而闻名的贝特·科博(Bette Korber)博士。

之后,D614G突变毒株成为全球科学家关注的焦点。

最近,来自美国斯克里普斯研究所的研究人员发现这种在美国、英国和意大利造成大量死亡的突变毒株,其传染性几乎比原始毒株高10倍。而造成其传染性如此强的原因是因为“D614G”毒株表面的刺突蛋白比原始毒株多4到5倍。

这种特性不仅使“D614G”毒株更具传染性,而且也使病毒更稳定、更有可塑性。

刺突蛋白,位于新冠病毒最外层,像一个个突起的“皇冠”。研究发现,新冠病毒感染人体细胞的关键在于冠状病毒的S蛋白与人体ACE2 蛋白的结合。准确地说,是S蛋白“劫持”了原本是控制血压的ACE2,通过与它的结合入侵人体。

刺突越多,病毒附着在人体细胞上的机会就更大,从而能进行更多的自我复制。在美国、意大利和英国传播的突变毒株无疑具有这种特性。

斯克里普斯研究所的研究人员分离出了各种各样的冠状病毒菌株,这些菌株已经通过它们的遗传特征在世界各地被识别出来。然后,研究人员将每一种菌株放入显微网箱匹配,测试各自的菌株在培养皿中入侵人体细胞的攻击性。

其中“D614G”是明显的“赢家”——病毒突变基因的重复,使它拥有更多的“刺突”蛋白。

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